森井除濕機的工作原理，簡單說是利用空氣中的水分在進入除濕機蒸發器時冷凝結霜，然后積聚滴出，排入下水口，從而達到降低空間濕度的目的。其原理與空調器制冷模式時的除濕原理類似。
　　空調器與森井除濕機工作方式的區別：
　　與獨立除濕模式相比較，制冷模式作為空調的基本功能，對空調器結構設計、控制方式的要求比較低，造價低廉，但在用這種方式達到抽濕目的的同時必然會造成房間溫度下降，這在溫度不高的時候是不實用并且浪費電力的。事實上制冷模式下的除濕功能只是一種副產品，并沒有增加空調器成本獨立除濕模式采用電加熱或熱交換方式加熱出風口空氣，控制會比較復雜一些，設計成本比較高，但這種溫度補償會使房間溫度波動比較小，適合在溫度并不高，但濕度太大的時候使用。
　　空調器在這兩種獨立抽濕模式下運行，其制冷系統處于運行狀態，蒸發器和冷凝器運行工況較為合理，能效比森井除濕機的工作方式是在機器內部降溫，把空氣中的水分析出，空間的溫度反而會略微上升，但溫差不明顯，比較適用于盛夏以外的潮濕季節，用電量也相對節約；但對除濕機而言，環境溫度低于15℃時，附著于蒸發器表面的水滴會結冰而使除濕效果減弱，若環境溫度超過40℃以上時，系統內壓力會增高而使壓縮機過載，此時過載保護器應切斷線路，否則壓縮機馬達會毀損。所以除濕機的佳使用溫度范圍為15℃～40℃。